斗转星移，与时俱进
基础医学院最早发端于解剖教研组、药理教研组、生理生化教研组、病理微寄教研组，2002年全部教研组整合成立基础教研室，学校升格后于2014年成立基础医学部。随着院系二级管理模式的运行，2021年10月成立基础医学院，下设党政办公室和教学科。基础医学院经过百年的砥砺发展，已成为集教学、科研和社会服务于一体的基础医学人才培养和科学研究基地。下设5个教研室：解剖教研室、病理教研室、生理教研室、药理教研室和微免生化教研室。承担了学院所有专业的《解剖》《病理》《生理》《药理》《微免》《生化》等医学基础课程，年平均近2万余学时教学任务。 1个医学基础科研中心，建成8间科研实验室，主要为分子生化和微生物两个研究方向。
基础医学院党支部成立于2018年11月，班子成员包括支部书记1人、副书记1人、支部委员1人，现有正式党员24名、发展对象1名，党建文化阵地3个。近年来，支部充分发挥党员的主体作用，以各项主题活动为载体不断凝心聚力，打造了一支齐心协力，迎难而上的党员队伍。其中硕士研究生占比67%，中级职称及以上占比50%，市级教学名师1名，院级骨干教师2名，党员发表sci论文4篇，1人在读博士，2人在读硕士。
默默耕耘，奉献讲坛
基础医学院岗位编制50个，设院长1名、副院长1名、党政办主任1名、教学科科长1名、教学管理干事2名、实验干事1名、行政科研干事1名、教研室主任5名、科研平台负责人1名、科研专职岗2名、专任教师32名、实验教师10名，校内兼课教师11名。专任教师职称结构：副教授5人占15%，讲师19人占61%。研究生19人占63%，博士在读1人，本科生11人占37%。教师队伍中骨干教师5人，双师20人，柔性引进博士1名。
默默耕耘，奉献讲坛是基础人的光荣传统。近年来，教师队伍中走出了2014年度自贡市师德标兵，自贡市“最美教师”陈岚，2015年度自贡市师德标兵李鹏杰，2017年四川省十大魅力教师毛双法，2018年度荣县脱贫攻坚工作先进个人刘明洋，2022年自贡市卫生系统优秀党员陈帅，自贡市“逆行骑士”杨勇等一批教师中的积极分子和先进典型，带动着青年教师不断提高。
自贡市“最美教师”陈岚
2015年度自贡市师德标兵李鹏杰
2017年四川省十大魅力教师毛双法
2018年度荣县脱贫攻坚工作先进个人刘明洋
科技创新，勤奋进取
基础医学院拥有着一支年轻的硕士研究生队伍，这只队伍创新性强，具有一定的科研实践能力。近年来，随着学院升格发展，系部积极响应学院十四五规划“创建双高”的发展战略目标，不断扩大教改和科研的课程广度和研究深度，成立医学基础科研中心，柔性引进博士1名带动教师科研能力不断提升。近三年来，基础医学院成功立项市厅级课题12项，院级科研课题23项，教师在各级各类刊物上发表专业学术文章60余篇，期中sci、核心10余篇。
躬行教学，累累硕果
优质教学质量是学院的根基，课程建设是学科建设、专业建设的基础。学院致力于夯实基础、提升内涵，着力培育目标作用大、影响深、教学覆盖面广的专业基础课程建设。近五年来，基础医学院承担各类精品课程、合格课程、教改课程等建设近17项，省级思政课程1项。教师参加国家级、省级、市级教学竞赛、微课比赛等获国家级一等奖2项、二等奖1项、国家级三等奖2项、省级一等奖1项，三等奖2项，另获各类奖项近60项。
展望未来，任重道远。基础医学院全体教职员工正以崭新的姿态，紧密团结在以习近平总书记为中心的党中央周围，努力贯彻党的教育方针，与时俱进，开拓创新，为把学院办成特色鲜明、教风优良、开拓奉献，声誉一流的基础医学高职教育和科学研究基地而不懈努力奋斗。
实验实训
解剖实验室：位于5号楼b区，总面积约2700平方米。目前有38间教学实验实训室，其中断层解剖标本陈列室1间、系统解剖标本陈列室2间，灌注室1间，标本制作室2间，另配有专门的挂图室1间和模型室1间。有真尸标本870多件，模型1100多个，尸柜11个，解剖台7个，完整挂图4套，解剖学虚拟教学系统41套。
病理实验室：位于5号楼b区，总面积约1200平方米。其中病理陈列室内置标本陈列柜 24个，标本约 256个，可同时容纳 150个学生参观。
生理药理实验室：位于3号楼c区 和5号楼a区，有实验准备室2间、医学虚拟实验室3间、医学机能实验室6间、药理生理实验室9间，总面积约1400平方米，能同时容纳600人左右学生参与教学。有vbl-100医学虚拟试验系统49套，生物机能实验系统16套。能为生理、病理生理、药理三门基础课程提供实验保障。
科研实验室：位于5号楼a区501——508室，现有面积约600平方米，拥有凝胶成像系统、核酸蛋白分析仪、梯度pcr仪、高速冷冻离心机等价值近百万的大型精密分析仪器，应用范围涉及医学及与医学相关的分子生物学、生物医学工程、生物科学与技术、化学等诸多领域。